Pioneer S-2EX, Совет по выбору АС

Если акустика прикручена к стойке, общий вес системы увеличивается (у меня увеличился почти в 2 раза), наверное, это должно сказаться на качестве баса.

А если не прикручена?

Лучше. Автор сам сообщил, что стойки несколько легче самих ящиков.
Следовательно прикрутив их насмерть он получил цельную высокую конструкцию с центром тяжести где-то примерно наполовину высоты.Ну и т.д.....

Всё, что вы описали, действительно имеет значение и почти все перечисленные вами болячки, например у меня, имели место быть. Что только не делал: и двигал, и снимал акустику с родных стоек, и ставил не неё 15-ти килограммовые мешки, и вешал тяжёлые занавески, и шипы менял... Комната подгужевала и где-то в районе 50Гц стояли ненавистные моды.  
Тут, полагаю, нужен комплексный подход. Как бы ни была хороша связка стойки+колонки, если вышеупомянутые задачи не решены, гонка за резонирующими неприятными частотами или борьба с им подобным звуковыми фантомами превратиться в хроническую болезнь. Болезнь под названием замена компонентов... В то время когда сама обсуждаемая акустика из категории мастхэв и все эти проблемы не по её вине.